Il Museo, fondato dal locale Gruppo Archeologico Aquaria, nasce nel 1979 con lo scopo di tutelare, valorizzare e promuovere il ricco patrimonio archeologico della zona nord orientale della Provincia di Cremona.
Ai materiali recuperati nei trent'anni di ricerche di superficie effettuate dal Gruppo, si sono aggiunti quelli provenienti dalle recenti scoperte fatte dalla Soprintendenza per i Beni Archeologici della Lombardia.
La nuova esposizione allestita nelle sale della Rocca Sforzesca di Soncino, rappresenta lo sviluppo della raccolta museale ospitata nella sede storica di Palazzo Covi a Gallignano. Attraverso un percorso cronologico e tematico articolato in diverse sezioni, il visitatore potrà ripercorrere le tappe del popolamento nel territorio dalla preistoria fino al XVII secolo inoltrato.